Introdução

• Apresentação da disciplina
• Introdução
• Histórico dos métodos e perguntas em Biogeografia Histórica

Preparando dados para análises biogeográficas

• Fontes de dados para análises biogeográficas: dados de distribuição e informações filogenéticas
• Seleção de problemas em biogeografia: tratamento de dados de distribuição e preparo de dados para análises biogeográficas históricas

Métodos de identificação, padrões distribucionais, áreas de endemismo e componentes bióticos e regionalização

• PAE e PAE/PCE (bônus no R com o a série de rotinas PanBioGeo!)
• Análise de Endemicidade (NDM/VNDM)
• Infomaps Bioregions
• Kernel
• Weight endemism
• Métodos de índices similaridade/dissimilaridade
• Discussão de artigos

Métodos biogeográficos cladísticos e de padrão

• Árvores livres de paralogia
• Análise de Parcimônia de Brooks (BPA) e suas variações
• transparent method (Ebach et al., 2005)
• SAMBA
• Análise Espacial de Vicariância – VIP (Método de Hovenkamp)

Métodos baseados em eventos e modelos

• Máxima verossimilhança e Bayesianismo
• DIVA e S-DIVA
• DIVA com verossimilhança (DIVALIKE)
• DEC
• BAYAREALIKE
• Escolha de modelos